低溫倉庫采用機械降溫的方法使庫內的溫度保持在+15℃以下，相對濕度控制在60%以下。經過試驗和大批生產用種貯藏表明，這類倉庫對于貯藏雜交種子和一些名貴種子，能延長其壽命和保持較高的發芽率。雖然，低溫低濕倉庫造價高，但是現代種子貯藏非常重要。這種倉庫必須配有成套的降溫除濕設備。
    低溫低濕種子庫的建筑結構，設備配置，溫濕度控制要求，檢測技術和種子管理等技術都與常溫庫有所不同。尤其是低溫低濕設備的選擇尤為重要。